Mes Recherches en écologie marine2020-11-21T18:49:15+01:00

Maïté Jacquot

« C’est en comprenant comment fonctionnent les écosystèmes que nous pourrons les protéger au mieux. »

Mes principaux intérêts de recherche sont la biodiversité et le fonctionnement des écosystèmes. Je m’intéresse particulièrement aux facteurs de stress environnementaux pouvant avoir un impact sur les communautés d’invertébrés vivant dans les sédiments marins.

Je suis actuellement doctorante à Åbo Akademi en Finlande.

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Mes domaines de recherche

Quelques questions que j’aborde dans mes recherches :

Les écosystèmes côtiers ont des biens et des services très précieux pour la société humaine et fournissent des fonctions écologiques importantes (telles que les productions primaires et secondaires et le cycle des nutriments).

Les invertébrés marins vivant dans ces zones, comme les vers, jouent un rôle important en reliant les matières organiques aux prédateurs, fournissant de la nourriture aux poissons, par exemple.

Les invertébrés marins ont des relations complexes avec leur environnement. En raison de leur mobilité réduite, ils ont une capacité limitée à éviter les perturbations environnementales et humaines. En conséquence, ils peuvent être particulièrement touchés par des facteurs de stress tels que la faible salinité, l’hypoxie, le dragage et l’eutrophisation, autant de stresseurs qui peuvent survenir dans les écosystèmes côtiers.

Dans ce contexte de changement climatique, il est essentiel d’identifier quels paramètres environnementaux ont un impact sur les invertébrés et comment?

Compétence & expertise :

Écologie des communautés
Facteurs environnementaux
Diversité benthique
Diversité fonctionnelle
Métabarcoding

Ma Thèse

De la macro- à la microfaune: réponses structurelles et fonctionnelles des communautés benthiques aux facteurs de stress abiotiques et biotiques

Les différents composants benthique (macrofaune, méiofaune et microfaune) des écosystèmes côtiers occupent une place centrale dans plusieurs fonctions écosystémiques. Alors que la macro et la méiofaune relient les matières organiques aux prédateurs, fournissant de la nourriture aux poissons, la microfaune joue un rôle crucial dans de nombreux cycles biogéochimiques mondiaux. Les organismes benthiques ont des relations complexes avec leur environnement et peuvent donc être particulièrement touchés par les perturbations environnementales et anthropiques. Ma thèse de doctorat vise à identifier les réponses structurelles et fonctionnelles des communautés macro, méio et microbenthos aux stress abiotiques et biotiques. Une analyse intégrée des groupes de classes de taille des espèces benthiques appartenant à différents groupes fonctionnels est considérée comme la meilleure approche pour comprendre l’écologie et le fonctionnement des côtes.

Afin d’identifier les changements dans la composition des communautés et la diversité des taxons benthiques, je combine l’identification taxonomique traditionnelle pour la macrofaune à des analyses de métabarcoding pour la méio et la microfaune. De plus, pour avoir différents niveaux de compréhension, je combine des études observationnelles quantitatives sur le terrain avec des expériences sur le terrain et en aquarium.

Mots clés

Écologie benthique
Diversité fonctionnelle
Stress environnementaux
Espèces invasives
Métabarcoding
Macrofaune
Méiofaune
Microfaune

Mes Projets

Projet de Thèse

EXP POISSON INVASIF

Une expérience pour comparer les impacts des poissons natifs et non-natifs

Projet de Thèse

SUMMERLAND

Une étude de terrain le long d’un gradient environnemental

Projet de Thèse

DISCOBOX

Une expérience avec des aquariums pour mesurer les impacts de vers non-natifs

Projet de Thèse

SPIGGoT

Une expérience en mésocosmes pour mesurer les impacts du changement climatique

Projet de Master

MOBILE BAY

Une étude de terrain pour identifier les stresseurs environnementaux pour les communautés d’invertébrés

Projet de Master

SENEGAL

Comment les communautés d’invertébrés sont affectées par la récolte de mollusques ?

Mes zones d’étude

Mon parcours

ÉTUDES & DIPLÔMES

En cours Thèse en Diversité Marine Fonctionnelle
Université d’Åbo Akademi (ÅAU)
Turku, Finlande
2016 Master en Sciences Biologiques de la Mer
Spécialité en écosystèmes marins
Université de Bretagne Occidentale (UBO)
Brest, France
2014 Licence en Biologie des Organismes
Université de Rennes
Rennes, France

LANGUES

  • Français – Langue maternelle
  • Anglais – Maîtrise

CERTIFICATION

PLONGÉE

  • Formation FFESSM niveau 3
  • Réaction et intervention face à un accident de plongée (RIFAP)

SAUVETAGE EN MER

  • Premiers soins en équipe niveau 1 (PSE1)
  • Permis bateau

EXPÉRIENCE EN RECHERCHE

En cours

Doctorat

Université d’Åbo Akademi
Biocity,
Turku, Finlande

De la macro- à la microfaune: réponses structurelles et fonctionnelles des communautés benthiques aux facteurs de stress abiotiques et biotiques

2016

Ingénieur d’études

La récolte des mollusques et les eaux usées comme facteurs structurant les communautés macrobenthiques dans un estuaire tropical inversé (Sénégal)

  • Analyse des données (logiciel R)

  • Rédaction d’un manuscrit scientifique pour publication dans Estuarine, Coastal and Shelf Science

2016

Stage de recherche

Facteurs structurants des communautés macrobenthiques et influence sur la dénitrification dans les sédiments mous (Mobile Bay, Alabama)

  • Mise en place de protocoles (terrain et laboratoire)

  • Échantillonnage: benne Petersen, benne Ekman, carottes en plongée

  • Tamisage, tri, identification taxonomique et biomasse des organismes de macrofaune

  • Analyse granulométrique des sédiments: granulométrie, porosité et teneur en C/N

  • Teneur en chlorophylle a (fluorométrie)

  • Flux de nutriments (incubation ex-situ)

  • Analyse des données (logiciel R)

  • Rédaction d’un manuscrit scientifique pour publication

2015

Stage de recherche

Effets de multiples pressions anthropiques sur les communautés macrobenthiques dans un estuaire inversé (Sine Saloum, Sénégal)

  • Tri et détermination des espèces de macrofaune

  • Détermination de la biomasse et conversion

  • Analyse des données (logiciel R): identification des facteurs structurants les communautés

2014
Sampling during low tide in France
  • Échantillonnage des sédiments: transect, chalutage, bennes Van Veen et Smith McIntyre

  • Analyse granulométrique des sédiments

  • Tamisage, tri et détermination des espèces de macrofaune benthique

  • Détermination des espèces, mesures de taille et pesée des échantillons de la directive-cadre sur l’eau (DCE) de l’UE (poissons, crevettes)

  • Introduction à la cartographie SIG (ArcGIS) et à la base de données Access

2013

Stage de recherche

Ichtyologie marine: caractérisation des habitats écologiques essentiels de certaines espèces de poissons côtiers (Bretagne, France)

  • Échantillonnage: pêche au lançon, Rance et Loire DCE (chalutage)

  • Dissection de juvénile de lançons et de bars : prélèvement d’échantillons (tissus musculaires, foie, branchies et reins) et extraction d’otolithes

  • Diversité fonctionnelle (traits fonctionnels, logiciel ImageJ, R)

  • Isotopie (lyophilisation, préparation des échantillons pour analyse isotopique)

FORMATIONS ACADÉMIQUES

2020

Cours ForBio

ForBio (Research School in Biosystematics) and Tromsø University Museum, Tromsø, Norway

Métabarcoding: Traitement et interprétation des données

  • Sessions pratiques: système d’exploitation UNIX, R Studio et OBITools, EcoPrimers & EcoPCR, indices de biodiversité et ordination multivariée sur R.

  • Conférences: par Eric Coissac, Pierre Taberlet, Tristan Cumer, Inger Alsos, Anthony Chariton, Sandra Garcés Pastor, Peter Heintzman, Nigel Yoccoz (Voir programme)

2016

Symposium Meioscool2016

Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), LabexMER, Ifremer, Plouzané, France

École d’été sur la méiofaune, une plongée dans un monde microscopique

  • Conférences

  • Sessions consacrées aux travaux de terrain et de laboratoire (échantillonnage, extraction, identification des principaux groupes taxonomiques de méiofaune…)

2015

École d’été

Université de Pierre et Marie Curry (UPMC),  Station Marine de Roscoff, France

Biodiversité marine, expertise faune

  • Terrain (en milieu intertidal et subtidal): exercices d’échantillonnage et détermination des espèces

  • Apprentissage de la taxonomie, la biologie, la phylogénie et l’écologie des espèces d’animaux marins en relation avec leurs habitats

2012

École d’été

Station Marine d’Arcachon
Université de Bordeaux 1
Arcachon, France

Écologie marine

  • Pratiques d’échantillonnage

  • Cours sur l’écologie des dunes, le plancton, l’ostréiculture, les bancs de coquilles et les herbiers.

Articles de blog

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